Sebagai sebuah organisasi, KPPBC Tipe Madya Pabean C Madiun merupakan bagian organisasi yang lebih besar yakni Kantor Wilayah DJBC Jawa Timur II. Sehingga visi dan misi yang dimiliki KPPBC Tipe Madya Pabean C Madiun adalah mengacu kepada Visi dan Misi Kantor Wilayah DJBC Jawa Timur II.
Visi
“MENJADI KANTOR PENGAWASAN YANG PROFESIONAL DAN KANTOR PELAYANAN YANG MENGUTAMAKAN LAYANAN PRIMA DI BIDANG KEPABEANAN DAN CUKAI“
Misi
“MENGEDEPANKAN KESEMPURNAAN LAYANAN DAN PENGAWASAN YANG MENYELURUH DALAM RANGKA MENGOPTIMALKAN PENERIMAAN NEGARA”
